За последнее десятилетие в Армении были сведены леса на площади более 30 тыс. га, что привело к активизации эрозионных процессов, нарушению экологического равновесия, развитию процессов опустынивания, в том числе в бассейне оз. Севан. Разрушены местообитания многих крупных млекопитающих и птиц, в результате снизилась их численность и увеличились популяции грызунов и вредных насекомых.

Крупнейшее и имеющее важное экономическое и рекреационное значение армянское озеро Севан в настоящее время считается зоной экологического бедствия. Использование его вод в ирригационных и энергетических целях привело к значительному снижению его уровня. Попадание в акваторию загрязненного отходами промышленных предприятий стока ряда рек привело к эвтрофикации озера, его «цветению» и гибели многих видов рыб, в частности к сокращению популяции севанского ишхана. Теперь этот вид занесен в Красную книгу. Принята долгосрочная правительственная программа по спасению озера Севан. Первоочередная задача сводится к восстановлению Воротанского водохранилища и строительству Воротанского туннеля, по которому в оз. Севан будет поступать ежегодно 190 млн. куб. м пресной воды. Это позволит поднять уровень озера на несколько метров. В более отдаленной перспективе планируется завершение строительства очистных станций в промышленных городах Мартуни, Варденис и Гавар, расположенных в бассейне озера Севан. Предполагается выделить средства на поддержание национального парка Севан.
Неблагоприятная экологическая обстановка сложилась в окрестностях металлургического комбината «Армянская медь» в Алаверди, Ванадзорского химического комбината и других промышленных центров. Из-за отсутствия передовых технологий эффективность переработки рудного сырья составляет всего 25%. При экстракции из него меди, молибдена, золота в отходах остаются такие ценные компоненты, как серебро, никель, платиноиды, сера, железо, оксиды металлов.